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蛋白質(zhì)分子的序列是蛋白質(zhì)發(fā)揮功能的基礎(chǔ)。準(zhǔn)確測(cè)定蛋白質(zhì)序列在在研究蛋白功能表位，檢測(cè)商業(yè)單克隆抗體，疫苗，以及試劑盒等藥物方面有著很重要的作用。雖然目前已有很多對(duì)蛋白測(cè)序的研究，但是目前對(duì)蛋白質(zhì)精準(zhǔn)測(cè)序還是不能夠像DNA一樣快速精準(zhǔn)。蛋白測(cè)序主要受制于蛋白樣品純化，構(gòu)成蛋白的氨基酸組成種類眾多等復(fù)雜因素影響。

這期給大家科普的技術(shù)叫做蛋白質(zhì)從頭測(cè)序（De novo se），又叫全新蛋白測(cè)序，這項(xiàng)技術(shù)是根據(jù)肽段與惰性氣體相碰撞產(chǎn)生的一系列的有規(guī)律的片段離子之間的質(zhì)量差來推斷氨基酸序列。我們可以根據(jù)肽鍵斷裂處的y離子和b離子來推測(cè)氨基酸序列，以及翻譯后修飾。De novo se有一項(xiàng)突出的優(yōu)勢(shì)，是傳統(tǒng)質(zhì)譜測(cè)序不能達(dá)到的，那就是不依賴任何蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)，對(duì)未知蛋白質(zhì)從頭測(cè)序。

在傳統(tǒng)測(cè)序中，往往只能檢測(cè)蛋白消化后的部分肽段序列，再用這些肽段序列與已知的蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)，根據(jù)一定算法打分，推算出可能性高的蛋白和序列。

傳統(tǒng)的測(cè)序的局限有：

1-. 質(zhì)譜測(cè)序依賴于公共數(shù)據(jù)庫(kù)。 如果所研究的物種的基因組沒有完全被測(cè)序，或者其中部分沒有對(duì)應(yīng)的序列， 那么質(zhì)譜測(cè)序?qū)o法得出正確的鑒定。

2. 使用的搜索引擎的打分和算法可能也會(huì)遺漏一部分的肽段和質(zhì)譜圖的匹配， 產(chǎn)生假陽(yáng)性結(jié)果。

3. 如果有點(diǎn)突變或者未知修飾存在的話， 由于搜庫(kù)算法或者參數(shù)設(shè)置中沒有考慮到， 同樣也無法得出正確的結(jié)果。

這些傳統(tǒng)質(zhì)譜測(cè)序的局限都可能在De novo se中被突破，因此選用De novo se可以提供傳統(tǒng)測(cè)序至今無法準(zhǔn)確評(píng)估的服務(wù)，包括：蛋白質(zhì)突變分析、全新蛋白／肽段從頭測(cè)序、單克隆抗體從頭測(cè)序等。

De novo se鑒定流程和具體特點(diǎn)

蛋白質(zhì)從頭測(cè)序分析流程

服務(wù)項(xiàng)目

從頭測(cè)序分析服務(wù)項(xiàng)目

服務(wù)優(yōu)勢(shì)

? 采用高精準(zhǔn)度質(zhì)譜儀Obitrap Fusion Lumos

? 全長(zhǎng)測(cè)序覆蓋率高達(dá)1_0_0_%

? 首位氨基酸測(cè)序準(zhǔn)確率高達(dá)95%

? 樣品用量低：蛋白樣品僅需100ug，即可完成檢測(cè)

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