第三類醫(yī)療器械經(jīng)營許可證的辦理方式：首先，當事人向所在地設區(qū)的市級人民政府負責藥品監(jiān)督管理的部門提出申請，并提交相關材料。然后，受理部門應當對申請資料進行審查。后，自受理申請之日起20個工作日內(nèi)作出決定。對符合條件的，準予許可并發(fā)給醫(yī)療器械經(jīng)營許可證。

法律依據(jù)：《醫(yī)療器械監(jiān)督管理條例》第二十條從事醫(yī)療器械生產(chǎn)活動，應當具備下列條件：

（一）有與生產(chǎn)的醫(yī)療器械相適應的生產(chǎn)場地、環(huán)境條件、生產(chǎn)設備以及技術人員；

（二）有對生產(chǎn)的醫(yī)療器械進行質(zhì)量檢驗的機構或者專職檢驗人員以及檢驗設備；

（三）有保證醫(yī)療器械質(zhì)量的管理制度；

（四）有與生產(chǎn)的醫(yī)療器械相適應的售后服務能力；

（五）產(chǎn)品研制、生產(chǎn)工藝文件規(guī)定的要求。